一是配额管理机制。配额管理机制主要包括碳配额和国家核证自愿减排量（CCER），以碳配额为主、CCER 为辅。碳配额发放主要有两种模式：免费发放和付费（拍卖或者固定价格），以免费发放为主，付费占比较低。8家试点
碳市场中只有6家可以通过拍卖的方式进行配额发放（
北京和
湖北试点碳市场只有免费配额发放机制），全国碳市场则采取免费分配的方式。
二是CCER抵消机制。除了配额之外，碳市场也可以采用CCER作为抵消机制，
碳排放强度较高的控排行业可以选择购买更多的CCER抵消部分碳排放，碳排放强度较低的控排行业和非控排行业也可以选择购买CCER后再次售卖给碳排放强度较高的控排行业。全国碳市场和试点碳市场对抵消上限、项目时间限制、项目地域限制和项目类型限制等方面做出了严格规定。
三是MRV管理机制。为保证全国碳市场和试点碳市场中碳排放数据的质量，我国参照CDM体系建立了MRV管理机制，对温室气体排放进行测量、报告和核查。
四是碳价调控机制。碳市场还设置碳价调控机制对碳价进行管理，以防碳价格波动过大，主要是对碳价涨幅、交易者头寸和交易量等进行调控。
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