区块链应用除了面对监管系统缺位、监管规则空白挑战外，还需要克服与现有法律系统的对接和协调问题，才能获得正式的合法性地位，这主要体现在智能合约的应用方面。目前，关于智能合约的论述大多集中于强调其如何实现可编程
金融以及如何取代中介机构等方面，而忽略了智能合约与现有法律系统尤其与合同法的协调和兼容。
首先，是关于语义解释和表达效力问题。现实生活中，受限于语义表达多意性和客观情况多变性，往往会出现法律未规定或双方未约定情形，需要对法律规定或合同条款进行解释，且这种解释往往涉及复杂的利益权衡和价值判断，应依靠具有公信力的第三方从中裁决；但智能合约却完全依靠计算机语言写就的程序在缔约方之间实现验证和执行，这必然会引发一个根本性问题，即程序代码是否能够精确地表达合同条款的语义以及合同条款是否又能准确表达当事人的意思，若不能表达，那么对于代码的语义应如何解释、由谁来解释，以及最为关键的一点——其是否属于被合同法所认可的有效合同形式？
其次，在智能合约执行过程中，一切均需听命于事先设定好的代码，而不考虑缔约方当下的真实意愿，若一方当事人某一操作失误或希望有其他选择，代码程序并未提供可修改的替代方案，则所谓“智能”并不智能，以致合同法上的合同变更、撤销和解除等制度根本无从适用，而这与近代私权社会所确立的基本民法理念“意思自治”是完全相悖的，让人不免担心智能合约在提高效率的同时可能也牺牲了一定的公平和自由。
智能合约虽然在某种程度上实现了技术与法律的协同，但还需要现行法律制度的进一步确认。
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