但不可否认，新的 Web 3.0 世界存在很重大的问题：低效。这与区块链从业者们认可的 Web 3.0 去中心化运行有直接关系，去中心化的效率相较于中心化的 Web 2.0 和传统意义上的 Web 3.0 来说，都要低的很多。
首先是去中心化网络对于任务处理的速度低下，这一点区块律动 BlockBeats 认为，任何区块链行业的从业者都会表示认可，即便是那些号称 Web 级的区块链项目也无法掩盖效率低的事实；然后是使用去中心化网络需要支付的隐性成本，进入 Web 3.0 的用户都会被「手续费」概念给弄糊涂，原本的互联网根本不存在手续费这件事。
Web 3.0 要对用户科普的内容要远远超过区块链、比特币、加密货币要科普的知识。当然，开发者也可以通过多样的设计将应用程序设计的和传统 App 无异，让用户根本感觉不到这些复杂的运行机制的存在。但这类开发工具，才刚刚起步。
Web 3.0 的普及难度可能很大，无论是对开发者的普及，还是对用户的普及，还是对企业的普及，都将异乎常规的难。尤其是在如今全球各个国家和地区都试图加强互联网监管的时代，Web 3.0 正在与政客们进行对抗。
再加上通证经济和人性自私，炒币远比做项目赚钱。为了取得大众信任，开发团队甚至需要定期露面来证明自己还在工作。如何把区块链运行得跟传统互联网一样，同时又能保持区块链的特性，是目前区块链开发者们仍在头疼和探索的难题。
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