相比非主权加密
数字货币，主权加密数字货币除了也借鉴和采用
区块链技术如分布式存储、“点对点”交易结算和不可篡改等优点外，还会有许多不同于非主权加密数字货币的特征。
首先，由于有掌控货币政策及预防
金融市场波动风险的需求，国家发行加密数字货币依然要采用“中心化”的方式，即主权加密数字货币将由各国货币发行机构统一发行和控制，具有国家信用背书及强制力，便于政府机构进行监管， 并加强流通的透明性，甚至实行实名化以保证加密数字货币的透明及法定权属的稳定。
其次，为了维护主权加密数字货币的系统稳定，国家发行机构必然不能采用与
比特币相同的“挖矿” 机制，需要只允许特定的银行或机构拥有记账权，而不是谁都可以进行记账，这样可以提高交易速度及安全性，满足一国乃至全球范围内的日均上千万次交易需求。
再次，由于国民生产总量的变化及保持价值稳定的需求，主权加密数字货币需要根据市场及政策进行总额的更改，在一般情况下，货币的发行增量应尽可能跟通货膨胀率靠近，这样可以保证加密数字货币的价值稳定并减少因货币宽松政策导致的货币贬值。
最后，由于对国家信用纸币的使用和依赖以及加密数字货币的市场教育需要一个较长的过程，主权加密数字货币将和国家信用纸币并存，但随着政策引导和人们对加密数字货币使用习惯的形成，主权加密数字货币将最终取代纸币。
Lotz 和 Vasselin 对加密数字货币和国家信用纸币的相互替代性进行了研究。他们利用模型得出，加密数字货币取代纸币的必要条件是相关设备的购置成本和使用成本足够低， 或者持有纸币的风险与加密数字货币相比足够高。人们在微信、支付宝等第三方支付工具进行付款，现金付款逐渐减少，一些发达国家正进行无纸化交易的研究，加密数字货币的流通已经势在必行。
此外，主权加密数字货币的推行并不等于非主权加密数字货币的消亡，其后者将会被边缘化但依然会以资产的性质存在， 并以主权加密数字货币单位进行计价，类似现在的股票、地产等资产计价方式，甚至不排除国家也可能开设专门的加密数字货币市场供各种加密数字货币进行交易，类似今天的股票交易市场，让市场来发现及评价其真实价值。
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