基于碳实测的核算法难以应对我国燃煤电厂煤质不稳定的客观情况。与欧美电厂来煤稳定且运行期内基本采用设计煤种的情况不同，我国燃煤电厂燃烧混煤是常态。配煤比例不同，煤质随之发生变化。企业按相关标准要求进行取样、制样、混样、检验等，燃煤的日综合煤样、月缩分煤样得出的检验结果仍然是对实际碳含量的统计推断。
碳核算指南没有发挥提高碳数据准确性的目的。核算指南要求过严过细，很多要求超出了电力企业日常生产数据管理的规范要求，增加了企业管理环节和管理成本，但并没有明显增加企业监测数据的准确度。
核查环节未充分发挥应有作用。据企业反映，第三方核查机构缺乏专业性，核查存在“走过场”现象，增加了管理环节，但企业数据质量未能得到有效提升。
企业数据质量管理有待加强。从中电联对发电行业
碳排放数据的分析情况看，重点排放单位仍存在指标检测不规范、数据统计不准确、参数使用不规范等数据质量问题。
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