在各种社会学方法论中，系统论是解读元宇宙的合适理论，这是由元宇宙社会治理思路决定的。元宇宙是一个规模成本递减、规模收益递增的生态系统，它的治理结构是分布式、去中心化、自组织的。分布式和去中心化这两个特征意味着元宇宙这个数字社会是一个复杂社会。在一个复杂社会中，以中心化决策为基础的控制思维势必会捉襟见肘，如果人们以存在统一权力中枢为前提的控制思维作为元宇宙的治理模式，就会导致一个去中心化的复杂社会被强行用中心化的治理模式进行控制，治理模式的不适配会阻碍元宇宙的落实。
为了适应元宇宙的去中心化特征，以决策中枢为核心的控制思维应当被放弃，与去中心化相匹配的系统思维应当被采纳，这种思维“一是没有强制性的中心控制；二是次级单位具有自治的特质；三是次级单位之间彼此高度连接”。根据系统思维，整体中的各个部分不是在整体的统一指令之下采取行动，而是在自身与整体之间进行沟通，在获取来自外部的信息的基础上，根据自己内部的逻辑来决定是否采取行动以及采取何种行动。系统的每个成员都要根据内部规则以及其所处的外部环境状况各自作出反应。这与服从来自中心的命令，或者根据整体环境做出步调一致的反应截然不同。凯文·凯利教授将系统思维形象地称为引导蜜蜂群生存发展的“蜂群思维”：“没有一只蜜蜂在控制它，但是有一只看不见的手，一只从大量成员中涌现出来的手，控制着整个群体。”
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